书籍摘要

《R Packages》第二版由Hadley Wickham和Jennifer Bryan合著，是一本全面深入的R包开发指南。本书旨在帮助R用户将代码转化为可共享、可维护的R包，涵盖了从基础开发到高级实践的各个方面。

书籍结构与内容

全书分为五个部分，内容层层递进，适合不同层次的读者。

第一部分：入门

• 第1章：完整的开发流程：通过一个小型示例包regexcite，展示了从创建到发布的完整过程，帮助读者快速了解R包开发的基本框架。
• 第2章：系统设置：介绍了开发R包所需的基础环境配置，包括R版本、开发工具链和devtools等工具的安装与使用。
• 第3章：包结构与状态：详细介绍了R包的五种状态（源代码、打包、二进制、安装和内存中）及其转换过程。
• 第4章：核心工作流：讲解了load_all()、document()、test()和check()等核心函数的使用，帮助读者建立高效的开发工作流。
• 第5章：从脚本到包：通过一个数据清洗脚本的案例，逐步提取可复用的逻辑和数据，将其转化为R包。

第二部分：包组件

• 第6章：R代码：讨论了如何组织R代码文件，推荐的代码风格，以及如何利用roxygen2生成文档。
• 第7章：数据：介绍了如何在包中包含数据，包括数据的存储、加载和文档化。
• 第8章：其他组件：涵盖了DESCRIPTION文件、NAMESPACE文件、inst/目录等其他重要组件的使用。

第三部分：包元数据

• 第9章：DESCRIPTION文件：详细解释了DESCRIPTION文件的各个字段及其重要性。
• 第10章：依赖关系：探讨了依赖的成本与收益，以及如何在DESCRIPTION文件中声明依赖。
• 第11章：依赖的使用：讲解了如何在包代码中使用依赖，包括导入和导出函数。
• 第12章：许可：介绍了如何为包选择合适的开源许可。

第四部分：测试

• 第13章：测试基础：介绍了testthat包的基本使用，如何编写和运行测试。
• 第14章：测试套件设计：讨论了如何设计测试套件，包括测试的组织和覆盖范围。
• 第15章：高级测试技巧：涵盖了测试中的高级主题，如测试依赖、测试数据的存储和清理等。

第五部分：文档

• 第16章：函数文档：讲解了如何使用roxygen2为函数编写文档。
• 第17章：文档：介绍了如何编写包的文档，包括README.md和NEWS.md。
• 第18章：其他Markdown文件：讨论了如何利用Markdown文件提供额外的包级文档。
• 第19章：网站：介绍了如何使用pkgdown为包创建网站。

书籍特色

• 实践导向：通过具体案例和代码示例，帮助读者快速上手。
• 工具集成：紧密结合devtools、usethis、testthat和roxygen2等工具，提供完整的开发体验。
• 社区支持：书中内容经过社区验证，适合个人开发者和团队协作。

《R Packages》第二版不仅是一本技术书籍，更是一本关于如何高效开发和维护R包的实用手册。无论是初学者还是经验丰富的开发者，都能从中获得宝贵的指导和启发。